preguntar acerca de dendrogram

Voici mon tracé résultant ci-dessous mais je voudrais qu'il ressemble aux dendrogrammes tronqués dans astrodendro: il y a aussi un dendrogramme à l'air vraiment cool de ce document que je voudrais recréer matplotlib. ci-Dessous est le code pour …

j'ai un heatmap (expression de gènes à partir d'un ensemble d'échantillons): set.seed(10) mat <- matrix(rnorm(24*10,mean=1,sd=2),nrow=24,ncol=10,dimnames=list(paste("g",1:24,sep=""),paste("sample",1:10,sep=""))) dend <- as.dendrogram(hclust(di …

j'utilise dendrogram de scipy pour tracer le groupement hiérarchique en utilisant matplotlib comme suit: mat = array([[1, 0.5, 0.9], [0.5, 1, -0.5], [0.9, -0.5, 1]]) plt.subplot(1,2,1) plt.title("mat") dist_mat = ma …

j'ai deux dendrogrammes que je souhaite comparer entre eux afin de découvrir comment ils sont" similaires". Mais je ne connais aucune méthode pour le faire (encore moins un code pour le mettre en œuvre, disons, en R). des pistes ? …

j'essaie de dessiner un lien complet scipy.cluster.hierarchy.dendrogram , et j'ai trouvé que scipy.cluster.hierarchy.linkage est plus lent que sklearn.AgglomerativeClustering . cependant, sklearn.AgglomerativeClust …