Difficulté à installer rgdal
je veux installer rgdal"R version 3.2.3 (2015-12-10)".
J'ai téléchargé et installé
- GDAL 1.11 Complete
- projet framework v4.9.2-2
- GEOS cadre de la v3.5.0-1
puis dans RStudio j'ai tapé install.packages("rgdal") ce qui m'a donné ceci:
> ....
>
> configure: CC: clang configure: CXX: clang++ configure: rgdal:
> 1.1-1 checking for /usr/bin/svnversion... yes configure: svn revision:
> 572 checking for gdal-config...
> no no configure: error: gdal-config
> not found or not executable. ERROR: configuration failed for package
> ‘rgdal’
> * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgdal’
> Warning in install.packages : installation of package ‘rgdal’ had
> non-zero exit status
> sessionInfo()
R version 3.2.3 (2015-12-10)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: OS X 10.10.5 (Yosemite)
locale:
[1] de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/C/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.2.3
j'ai aussi essayé dans le terminal
R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config
--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers
--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'
et
sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar
Pas de chance!
4 réponses
finalement résolu.
Ici est de savoir comment nous avons fait! OS X 10.10.5 R 3.2.3 GDAL 1.1
- télécharger et installer le Framework complet GDAL à partir de ici
- dites à votre OS X où trouver le
gdal-configfichier en tapant ceci dans votre shellecho 'export PATH=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs:$PATH' >> ~/.bash_profileetsource ~/.bash_profile - vérifiez si votre GDAL fonctionne bien en tapant bash
gdalinfo --version. Que devrait revenir avec quelque chose commeGDAL 1.11.3, released 2015/09/16. - pour la plupart les gens, en commençant R et en tapant
install.packages("rgdal")fonctionne (si vous avez fait l'étape 1-3). Cependant, ce n'était pas le cas pour moi. Donc, continuez avec 5 Si vous avez encore des problèmes. - Aller à l' GDAL site web et télécharger le
.tarfichier. - Dans le shell, essayez ceci:
sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar. Qui toujours m'a donné une erreur:configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’ - donc, vous devez de nouveau dire où trouver celui-là. Essayer:
R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'
ça devrait marcher. Essayez en commençant R et tapez library(rgdal).
Remarque:rgoes j'ai expérimenté des problèmes similaires. m'a aidé.
À essayer:
R CMD INSTALL rgeos_0.3-15.tar --configure-args='--with-geos-config=/Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config
--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers
--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'
pour pointer vers le config fichier. Ses ici /Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config
petite note en s'appuyant sur la réponse précédente de @Stophface qui pourrait être utile à quelqu'un:
j'ai fait toutes les étapes énumérées ci-dessus, mais l'installation rgdal dans le Terminal m'a quand même donné l'erreur de configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. Pourtant (et sans savoir exactement pourquoi), j'ai réussi à l'installer à partir de R. app en utilisant à peu près les mêmes spécifications:
> install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c(
'--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config',
'--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers',
'--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))
Et merci encore pour votre réponse!
j'ai eu la même erreur avec R 3.4.0 sur macOS Sierra (10.12). Donc j'ai utilisé homebrew pour installer gdal, puis rgdal installé comme d'habitude dans R
En Terminal
brew update
brew install gdal
R
install.packages("rgdal")
devtools::session_info()
Session info ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
setting value
version R version 3.4.0 (2017-04-21)
system x86_64, darwin15.6.0
ui RStudio (1.0.143)
language (EN)
collate en_AU.UTF-8
tz Australia/Melbourne
date 2017-04-24
Packages --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
package * version date source
devtools 1.12.0 2016-12-05 CRAN (R 3.4.0)
digest 0.6.12 2017-01-27 CRAN (R 3.4.0)
lattice 0.20-35 2017-03-25 CRAN (R 3.4.0)
memoise 1.1.0 2017-04-21 CRAN (R 3.4.0)
rgdal * 1.2-6 2017-04-06 CRAN (R 3.4.0)
sp * 1.2-4 2016-12-22 CRAN (R 3.4.0)
withr 1.0.2 2016-06-20 CRAN (R 3.4.0)
Je l'ai installé via conda sur mon Mac (OS X 10.10.5). L'installation était simple. Si vous êtes nouveau à conda, cochez cette http://conda.pydata.org/docs/r-with-conda.html
conda install gdal
gdalinfo --version
# GDAL 2.1.0, released 2016/04/25
R Installation du paquet:
install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c(
'--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config',
'--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers',
'--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))
install.packages('rgeos', type = "source", configure.args=c(
'--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config',
'--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers',
'--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))
install.packages('maptools', dependencies=TRUE)