Méthode pour sauvegarder networkx graph sur JSON graph?

documentation contient une description complète

voici un exemple simple:

import networkx as nx
from networkx.readwrite import json_graph

DG = nx.DiGraph()
DG.add_edge('a', 'b')
print json_graph.dumps(DG)

Vous pouvez aussi jeter un oeil à l' Javascript / SVG / D3 bel exemple sur l'ajout de la physique à la visualisation graphique.

Voici une approche JSON que je viens de faire, avec le code pour lire les résultats. Il enregistre les attributs node et edge, au cas où vous en auriez besoin.

import simplejson as json
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
# add nodes, edges, etc to G ...

def save(G, fname):
    json.dump(dict(nodes=[[n, G.node[n]] for n in G.nodes()],
                   edges=[[u, v, G.edge[u][v]] for u,v in G.edges()]),
              open(fname, 'w'), indent=2)

def load(fname):
    G = nx.DiGraph()
    d = json.load(open(fname))
    G.add_nodes_from(d['nodes'])
    G.add_edges_from(d['edges'])
    return G

en Général j'utilise le code suivant :

import networkx as nx; 
from networkx.readwrite import json_graph;
G = nx.Graph();
G.add_node(...)
G.add_edge(...)
....
json_graph.node_link_data(G)

il va créer un graphique formaté json dans lequel les noeuds sont nodes et arêtes links en plus d'autres informations sur le graphique (directionnalité ... etc)

Les noeuds et les bords sont-ils assez informatifs? Si oui, vous pouvez écrire votre propre fonction:

json.dumps(dict(nodes=graph.nodes(), edges=graph.edges()))

essaye ceci:

# Save graph
nx.write_gml(G, "path_where_graph_should_be_saved.gml")

# Read graph
G = nx.read_gml('path_to_graph_graph.gml')