Comment créer des échantillons de test et de formation à partir d'un dataframe avec des pandas?
J'ai un ensemble de données assez volumineux sous la forme d'un dataframe et je me demandais comment je serais capable de diviser le dataframe en deux échantillons aléatoires (80% et 20%) pour la formation et les tests.
Merci!
16 réponses
, je voudrais juste utiliser numpy est randn
:
In [11]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(100, 2))
In [12]: msk = np.random.rand(len(df)) < 0.8
In [13]: train = df[msk]
In [14]: test = df[~msk]
Et juste pour voir cela a fonctionné:
In [15]: len(test)
Out[15]: 21
In [16]: len(train)
Out[16]: 79
Scikit learn train_test_split
est un bon.
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.model_selection import train_test_split
train, test = train_test_split(df, test_size=0.2)
Pandas échantillon aléatoire fonctionnera également
train=df.sample(frac=0.8,random_state=200)
test=df.drop(train.index)
J'utiliserais le propre training_test_split de scikit-learn, et le générerais à partir de l'index
from sklearn.cross_validation import train_test_split
y = df.pop('output')
X = df
X_train,X_test,y_train,y_test = train_test_split(X.index,y,test_size=0.2)
X.iloc[X_train] # return dataframe train
Vous pouvez utiliser le code ci-dessous pour créer des échantillons de test et de train:
from sklearn.model_selection import train_test_split
trainingSet, testSet = train_test_split(df, test_size=0.2)
La Taille du Test peut varier en fonction du pourcentage de données que vous souhaitez mettre dans votre jeu de données de test et de formation.
Il y a beaucoup de réponses valables. En ajoutant un de plus au groupe. de sklearn.cross_validation importation train_test_split
#gets a random 80% of the entire set
X_train = X.sample(frac=0.8, random_state=1)
#gets the left out portion of the dataset
X_test = X.loc[~df_model.index.isin(X_train.index)]
Vous pouvez également envisager une division stratifiée en ensemble de formation et de test. Startified division génère également des ensembles de formation et de tests aléatoires, mais de telle sorte que les proportions de classe d'origine soient préservées. Cela permet aux ensembles de formation et de test de mieux refléter les propriétés de l'ensemble de données d'origine.
import numpy as np
def get_train_test_inds(y,train_proportion=0.7):
'''Generates indices, making random stratified split into training set and testing sets
with proportions train_proportion and (1-train_proportion) of initial sample.
y is any iterable indicating classes of each observation in the sample.
Initial proportions of classes inside training and
testing sets are preserved (stratified sampling).
'''
y=np.array(y)
train_inds = np.zeros(len(y),dtype=bool)
test_inds = np.zeros(len(y),dtype=bool)
values = np.unique(y)
for value in values:
value_inds = np.nonzero(y==value)[0]
np.random.shuffle(value_inds)
n = int(train_proportion*len(value_inds))
train_inds[value_inds[:n]]=True
test_inds[value_inds[n:]]=True
return train_inds,test_inds
Df [train_inds] et DF [test_inds] vous donnent les ensembles de formation et de test de votre DF DataFrame d'origine.
C'est ce que j'ai écrit quand j'avais besoin de diviser un DataFrame. J'ai envisagé d'utiliser L'approche D'Andy ci-dessus, mais je n'ai pas aimé que je ne puisse pas contrôler exactement la taille des ensembles de données (c'est-à-dire que ce serait parfois 79, parfois 81, etc.).
def make_sets(data_df, test_portion):
import random as rnd
tot_ix = range(len(data_df))
test_ix = sort(rnd.sample(tot_ix, int(test_portion * len(data_df))))
train_ix = list(set(tot_ix) ^ set(test_ix))
test_df = data_df.ix[test_ix]
train_df = data_df.ix[train_ix]
return train_df, test_df
train_df, test_df = make_sets(data_df, 0.2)
test_df.head()
Il suffit de sélectionner la ligne de plage de df comme ceci
row_count = df.shape[0]
split_point = int(row_count*1/5)
test_data, train_data = df[:split_point], df[split_point:]
Si vous souhaitez avoir un dataframe et deux dataframes (pas des tableaux numpy), cela devrait faire l'affaire:
def split_data(df, train_perc = 0.8):
df['train'] = np.random.rand(len(df)) < train_perc
train = df[df.train == 1]
test = df[df.train == 0]
split_data ={'train': train, 'test': test}
return split_data
Je pense que vous devez également obtenir une copie pas une tranche de dataframe si vous voulez ajouter des colonnes plus tard.
msk = np.random.rand(len(df)) < 0.8
train, test = df[msk].copy(deep = True), df[~msk].copy(deep = True)
Vous pouvez utiliser la fonction DF.as_matrix() et créer Numpy-array et le transmettre.
Y = df.pop()
X = df.as_matrix()
x_train, x_test, y_train, y_test = train_test_split(X, Y, test_size = 0.2)
model.fit(x_train, y_train)
model.test(x_test)
Et ça? df est mon dataframe
total_size=len(df)
train_size=math.floor(0.66*total_size) (2/3 part of my dataset)
#training dataset
train=df.head(train_size)
#test dataset
test=df.tail(len(df) -train_size)
Si vous devez diviser vos données par rapport à la colonne lables dans votre ensemble de données, vous pouvez utiliser ceci:
def split_to_train_test(df, label_column, train_frac=0.8):
train_df, test_df = pd.DataFrame(), pd.DataFrame()
labels = df[label_column].unique()
for lbl in labels:
lbl_df = df[df[label_column] == lbl]
lbl_train_df = lbl_df.sample(frac=train_frac)
lbl_test_df = lbl_df.drop(lbl_train_df.index)
print '\n%s:\n---------\ntotal:%d\ntrain_df:%d\ntest_df:%d' % (lbl, len(lbl_df), len(lbl_train_df), len(lbl_test_df))
train_df = train_df.append(lbl_train_df)
test_df = test_df.append(lbl_test_df)
return train_df, test_df
Et l'utiliser:
train, test = split_to_train_test(data, 'class', 0.7)
Vous pouvez également passer random_state si vous voulez contrôler le caractère aléatoire fractionné ou utiliser une graine aléatoire globale.
Pour diviser en plus de deux classes telles que train, test et validation, on peut faire:
probs = np.random.rand(len(df))
training_mask = probs < 0.7
test_mask = (probs>=0.7) & (probs < 0.85)
validatoin_mask = probs >= 0.85
df_training = df[training_mask]
df_test = df[test_mask]
df_validation = df[validatoin_mask]
Cela mettra 70% des données en formation, 15% en test et 15% en validation.
import pandas as pd
from sklearn.model_selection import train_test_split
datafile_name = 'path_to_data_file'
data = pd.read_csv(datafile_name)
target_attribute = data['column_name']
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(data, target_attribute, test_size=0.8)